Жанры:

1. 2005 - Детская книга (будущее, 2006, 1914, 1605—1606 годы)
2. 2005 - Шпионский роман (1941 год)
3. 2005 - Фантастика (1980—1991 годы)
4. 2008 - Квест (полный вариант) (1930, 1812 годы)
Приключения Эраста Фандорина

0. 2006 - Инь и Ян
1. 1998 - Азазель (1876 год)
2. 1998 - Турецкий гамбит (1877 год)
3. 1998 - Левиафан (1878 год)
4. 1998 - Смерть Ахиллеса (1882 год)
5. 1999 - Особые поручения: Пиковый валет (1886 год)
6. 1999 - Особые поручения: Декоратор (1889 год)
7. 1999 - Статский советник (1891 год)
8. 2000 - Коронация, или Последний из романов (1896 год)
9. 2001 - Любовница смерти (1900 год)
10. 2001 - Любовник смерти (1900 год)
11. 2003 - Алмазная колесница. Том 1 (1878 и 1905 годы)
11. 2003 - Алмазная колесница. Том 2 (1878 и 1905 годы)
12. 2007 - Нефритовые четки (1881—1900 годы)
13. 2009 - Весь мир театр (1911 год)
Приключения Николаса Фандорина

1. 2000 - Алтын-Толобас (1995, 1675—1676 годы)
2. 2002 - Внеклассное чтение. Том 1 (2001, 1795 годы)
3. 2002 - Внеклассное чтение. Том 2 (2001, 1795 годы)
4. 2006 - Ф. М. Том 1 (2006, 1865 годы)
5. 2006 - Ф. М. Том 2 (2006, 1865 годы)
6. 2009 - Сокол и Ласточка (2009, 1702 годы)
Провинцiальный детективъ

1. 2000 - Пелагия и белый бульдог
2. 2001 - Пелагия и чёрный монах
3. 2003 - Пелагия и красный петух

Сказки для идиотов

1. 2000 - Страсть и долг
2. 2000 - Невольник чести
3. 2000 - Восток и Запад
4. 2000 - Спаситель отечества
5. 2000 - Тефаль, ты думаешь о нас
6. 2000 - PSTD
7. 2000 - Дары Лимузины
8. 2000 - Проблема 2000
Смерть на брудершафт

1. 2007 - Смерть на брудершафт (Фильма 1-2) [Младенец и черт + Мука разбитого сердца] (1914 год)
2. 2008 - Смерть на брудершафт (Фильма 3-4) [Летающий слон + Дети Луны] (1915 год)
3. 2009 - Смерть на брудершафт (фильма 5-6) [Странный человек + Гром победы, раздавайся] (1915, 1916 годы)
4. 2010 - Смерть на брудершафт (фильма 7-8) [«Мария», Мария… + Ничего святого]
5. 2011 - Смерть на брудершафт (фильма 9-10) [Операция «Транзит» + Батальон ангелов]
Другие произведения

1. 1993 - Жизнь и смерть Юкио Мисимы, или Как уничтожить храм
2. 1997 - Писатель и самоубийство
3. 2000 - Чайка
4. 2002 - Зеркало Сен-Жермена
5. 2002 - Гамлет
6. 2004 - Кладбищенские истории

Переводы Б. Акунина

1. Маруяма. В небе снова радуга (пер. Борис Акунин)
2. Бойл. Восток есть Восток (пер. Борис Акунин)
3. Бойл. Крупная дичь (пер. Борис Акунин)
4. Тавада. Собачья невеста (пер. Борис Акунин)
5. Симада. Царь Армадилл (пер. Борис Акунин)
6. Мисима. Маркиза де Сад (пер. Борис Акунин)
7. Мисима. Мой друг Гитлер (пер. Борис Акунин)
8. Мисима. Золотой храм (пер. Борис Акунин)
9. Адам Далглиш. Неестественные причины (пер. Борис Акунин)
10. Маруяма. Сердцебиение (пер. Борис Акунин)
11. Мисима. Солнце и сталь (пер. Борис Акунин)
12. Моримура. Испытание зверя (пер. Борис Акунин)
13. Брэдбери. Профессор Криминале (пер. Борис Акунин)
Под псевдонимом Брусникин

В ноябре 2007 года издательство АСТ выпустило в свет историко-приключенческий роман "Девятный Спас", автором которого является Анатолий Брусникин. Несмотря на то,что Брусникин был доселе неизвестен как автор, издательство потратило большие средства на рекламную кампанию романа, что моментально породило слухи о том,что под псевдонимом Брусникин скрывается один из известных русских писателей.
Подозрение пало в том числе и на Акунина. Текстологический и стилистический анализ романа позволяет проследить некоторое сходство с языком Акунина и литературными приемами,используемыми им. Это может означать как то, что Акунин является автором романа, так и то, что он, возможно, принимал участие в его создании. Более того, Анатолий Брусникин - это анаграмма имени Борис Акунин. АСТ также опубликовало фотографию Брусникина, человек на которой может напоминать Бориса Акунина в молодости.
В 2010 г. вышел новый роман Анатолия Брусникина "Герой иного времени", действие которого происходит во время Кавказской войны в 40-е годы 19 века.

1. 2007 - Девятный Спас
2. 2010 - Герой иного времени

Публицистика

1. Если бы я был газетным магнатом
2. Но нет Востока и Запада нет
3. Японец: натура и культура
4. Ответы Акунина после "Сокола и Ласточки" (летняя серия 2009)
5. Ответы Акунина после "Гром победы, раздавайся!" (осенняя серия 2009)
6. Ответы Акунина после «Весь мир театр» (зимняя серия 2009-2010)
7. Девочка и медведь