Храм святителя Николая Пыжах был основан в конце 16 века, примерно в 1593 году. Однако в то время он был посвящен празднику Благовещения Пресвятой Богородицы и был еще деревянным. Приход храма составляли стрельцы полка стольника Философова. В царствование Алексея Михайловича полк Философова был отправлен в Киев.Их сменили стрельцы полка Богдана Пыжова, от имени которых храм и получил свое нынешнее название.
Храм святителя Николая в Пыжах является выдающимся памятником архитектуры. Грозным испытанием для храма стало наполеоновское нашествие.