В игре Bioshock 2 Вам предстоит выступить в роли самого первого Большого Папочки, сохранившего волю и разум. Десять лет спустя после событий оригинальной игры в небольшом городке на побережье Атлантического океана начинают твориться странные и зловещие вещи - там пропадают маленькие девочки. Следы похитителя теряются в прибрежных водах, и становится очевидно, что разгадку тайны нужно искать под водой. На дне океана в руинах некогда прекрасного фантастического мегаполиса Вы должны сразиться со своими собратьями, с мутантами и с новой хозяйкой Восторга - повзрослевшей Сестричкой…